小儿慢性腹泻的病程一般会持续两个月左右，还有的患儿可能不会持续性的腹泻，但每次发作间隔时间都在两到四周不等。患儿每次病情发作时，都会表现为大便次数增加、大便性状稀薄，且伴随有腹痛、肚脐胀痛的症状。而导致慢性腹泻病程延长的原因，主要是原发病未能及时控制有关。

大多数患者会出现慢性腹泻，主要是因为消化不良、受到感染、脂肪吸收不良或食物中毒所造成的，例如经常吃一些油腻且不容易消化或腐烂的食物，就很容易导致腹泻发烧。除此之外，还有部分患者是因为本身就患有肠道疾病所引起的慢性腹泻，这都需要尽早接受治疗。

出现慢性腹泻症状时，可以服用西药进行治疗，比如用益生菌调理肠道菌群，用蒙脱石散、诺氟沙星胶囊等止泻；也可以辨证服用中药治疗，比如黄连素、加味胃苓汤、参苓白术散等，都可以起到不错的止泻效果。

慢性腹泻的常见并发症为营养不良和维生素缺乏症，与长期性大便次数增多和营养流失有关。同时会导致抵抗力下降，而出现真菌性肠炎一类继发性感染疾病。部分患者可能会并发中毒性肝炎，还可有电解质紊乱及肠出血的可能性，严重时会导致肾衰竭。

慢性腹泻能否自愈，需要看病情的严重程度。如果只是饮食不当、着凉等原因引起的轻微腹泻，注意合理饮食、适度锻炼、保暖防寒等，可以实现自愈的目的；如果是细菌、病毒感染引起的慢性腹泻，症状严重时，需要及时治疗，很难自愈。